集装箱运输是以集装箱为运输单位进行运输的一种现代化的先进的运输方式，期运费的构成和计算方法与传统的运输方式不同.以海运为例，它包括内陆或装运港市内运输费、拼箱服务费、堆场服务费、海运运费、集装箱及其设备使用费等。
内陆运输费(inland transport charge)或装运港市内运输费主要包括区域运费、无效拖运费、变更装箱地点费等。内陆或港口市内运输可以由承运人负责，也可以由货主自理。如由货主自理，有关费用负担和支付按买卖合同规定，由发货人或收货人负责。在通常情况下，在出口地发生的费用由发货人负责，在进口地发生的费用由收货人负责。
拼箱服务费(LCL service charge)包括拼箱货在货运站至堆场之间空箱或重箱的运输、理货、货运站内的搬运、分票、堆存、装拆箱以及签发场站收据、装箱单制作等各项服务费用。
堆场服务费(terminal handling charge)，也称码头服务费，包括在装船港堆场接受来自货主或集装箱货运站的整箱货和堆存、搬运至装卸桥下的费用，以及在卸货港的从装卸桥下接收进口箱，将箱子搬运到堆场和在堆场的堆存费用。堆场服务费还包括在装卸港的有关单证费用。
集装箱及其他设备使用费(fee for use container and other equipments)是指当货主使用由承运人提供的集装箱及底盘车等设备时发生的费用。它还包括集装箱从底盘车上吊上吊下的费用。
集装箱海运运费由船舶运费和有关杂费组成。目前计收方法基本上有两种：一种是按每运费吨计收运费。计算方法与传统件杂货相同。拼箱货常采用这种方法;另一种是以每个集装箱作为计费单位，按包箱费率(box—rate)计算运费。整箱货通常按一个货柜计收运费。
集装箱的包箱费率有三种规定方法：
(1)FAK包箱费率(freight for all kinds)，即不分货物种类，也不计货量，只规定统一的每个集装箱收取的费率;其形式如表1-3。
(2)FCS包箱费率(freight for class)，即按不同货物等级制定的包箱费率。货物等级也是1~20级，但级差较小。一般低价货费率高于传统运输费率，高价货则低于传统费率;同一等级货物，实重货运价高于体积货运价。其形式如表1-4。
(3)FCB包箱费率(freight for class & basis)，即按不同货物等级或货物类别以及计算标准制定的费率。同一级费率因计算标准不同，费率也不同。如8~10级，CY/CY交接方式，20英尺集装箱货物如按重量计费费率为1500美元，如按尺码计费费率则为1450美元。其形式如表1-5。
集装箱海运运费的具体计算方法：
首先通过查货物等级表得出货物的等级，然后查费率表，按航线和货物等级查出整箱或拼箱的基本费率。
另外还要确定所运输货物为整箱货还是拼箱货。若为拼箱，应先算出所装箱的确切数量，再按件杂货的计算方法查费率表计算;若为整箱货，直接按表中给出的单箱运费计算即可。当托运货物的数量部分装整箱，部分以拼箱方式运输时，需混合这两种计算方式。
集装箱整箱货量的计算方式有两种：一种是用集装箱的长、宽、高分别除以单件货物的长、宽、高，得出其中最大的货量计算 。另一种是按经验值，仅考虑集装箱得有效容积。通常20’柜得有效容积为25立方米，有效重量为17.5公吨，40’柜得有效容积为55立方米，有效重量为27.5公吨。一般以M为计算标准得轻泡货装40’柜，以W为计算标准的实重货装20’柜。
